甘肅(su)畜牧工程職業(ye)技術學(xue)院位(wei)于祁連山北麓，河(he)西走廊(lang)東端(duan)的古絲(si)綢之(zhi)路(lu)重鎮——武威市涼(liang)州區黃羊鎮。由始建于1952年(nian)的原甘肅(su)省畜牧學(xue)校和始建于1958年(nian)的原甘肅(su)省農(nong)業(ye)機械(xie)化學(xue)校兩所國家級重點中專合并組(zu)建而成。

1952年經(jing)西(xi)(xi)北(bei)(bei)軍(jun)(jun)政委(wei)(wei)員會畜(chu)(chu)牧(mu)部(bu)提請西(xi)(xi)北(bei)(bei)軍(jun)(jun)政委(wei)(wei)員會財經(jing)委(wei)(wei)員會以(yi)【1952】財經(jing)農字第6652號批準，學(xue)校在西(xi)(xi)安成(cheng)立，原名(ming)西(xi)(xi)北(bei)(bei)畜(chu)(chu)牧(mu)獸(shou)醫技術學(xue)校，直屬(shu)西(xi)(xi)北(bei)(bei)畜(chu)(chu)牧(mu)部(bu)領(ling)導。面向(xiang)西(xi)(xi)北(bei)(bei)五省(sheng)區培養中(zhong)等畜(chu)(chu)牧(mu)獸(shou)醫轉業干部(bu)。

1953年(nian)，陜西(xi)武功(gong)農業學校(xiao)畜(chu)牧科并(bing)入，學校(xiao)改名為西(xi)安畜(chu)牧學校(xiao)。

1954年，西(xi)北行(xing)政委員會（原西(xi)北軍(jun)政委員會）撤銷(xiao)，學(xue)校移交甘肅省。

1956年(nian)甘肅(su)省畜牧廳在原武威縣黃羊鎮選(xuan)定新校(xiao)址，并開始(shi)動(dong)工建(jian)校(xiao)。

1958年，學校遷入(ru)黃羊鎮(zhen)，更名(ming)為(wei)甘肅省畜牧學校。同年，甘肅省農業機械(xie)化學校也在黃羊鎮(zhen)建(jian)成招生。

1960年(nian)，經甘(gan)(gan)肅(su)省(sheng)畜牧廳提請甘(gan)(gan)肅(su)省(sheng)委(wei)同(tong)意(yi)，成立了“甘(gan)(gan)肅(su)省(sheng)畜牧獸(shou)醫專科學(xue)校(xiao)”與畜牧學(xue)校(xiao)為同(tong)一組(zu)織機構；同(tong)年(nian)，經甘(gan)(gan)肅(su)省(sheng)政府批準，甘(gan)(gan)肅(su)省(sheng)武威農(nong)業機械(xie)化學(xue)校(xiao)升格為“甘(gan)(gan)肅(su)省(sheng)農(nong)業機械(xie)化學(xue)院”。

1961年，根據甘(gan)肅(su)(su)省(sheng)(sheng)教(jiao)育(yu)廳(ting)提出(chu)的“關于全省(sheng)(sheng)高(gao)等(deng)學(xue)(xue)校(xiao)調整方案”，甘(gan)肅(su)(su)省(sheng)(sheng)畜牧(mu)獸(shou)醫專科學(xue)(xue)校(xiao)和甘(gan)肅(su)(su)省(sheng)(sheng)農(nong)業機(ji)械化學(xue)(xue)院相(xiang)繼撤銷(xiao)，兩(liang)校(xiao)均恢復(fu)原校(xiao)名(ming)。同年5月(yue)，張掖農(nong)業機(ji)械化學(xue)(xue)校(xiao)和農(nong)墾(ken)干校(xiao)并入(ru)甘(gan)肅(su)(su)省(sheng)(sheng)農(nong)業機(ji)械化學(xue)(xue)校(xiao)。

1962年(nian)5月，兩校(xiao)奉(feng)命(ming)停辦。甘肅(su)(su)省(sheng)(sheng)畜牧(mu)學校(xiao)與西北(bei)畜牧(mu)獸醫(yi)研究(jiu)所黃羊鎮實驗牧(mu)場(chang)合并，成立了(le)甘肅(su)(su)省(sheng)(sheng)畜牧(mu)學校(xiao)實習牧(mu)場(chang)；甘肅(su)(su)省(sheng)(sheng)農(nong)業(ye)機(ji)械(xie)化學校(xiao)與省(sheng)(sheng)農(nong)科(ke)院(yuan)、古浪縣(xian)拖(tuo)拉機(ji)站(zhan)合并，成立了(le)甘肅(su)(su)省(sheng)(sheng)黃羊鎮拖(tuo)拉機(ji)站(zhan)。

1962年(nian)底和1963年(nian)初，兩校(xiao)奉命復辦(ban)，各自恢復了(le)原校(xiao)名。1963年(nian)9月，兩校(xiao)均(jun)恢復了(le)普通中專招生。

1964年兩校停辦時保(bao)留學籍的學生復課。同年，平涼拖拉機(ji)技工學校并入甘肅省(sheng)農業(ye)機(ji)械化學校。

1966年文(wen)化大(da)革命開(kai)始，軍宣隊(dui)、工宣隊(dui)相繼進駐兩校，組(zu)織開(kai)展“斗、批、改”運動。

1969年甘(gan)肅省農業(ye)機械(xie)化學(xue)校實(shi)習(xi)工(gong)(gong)廠(chang)改為(wei)甘(gan)肅省第二拖拉機配(pei)件廠(chang)，學(xue)校附(fu)屬(shu)于工(gong)(gong)廠(chang)，成為(wei)“廠(chang)辦校”。

1970年，甘肅(su)省畜(chu)牧學校下放給武威地(di)區，更名為甘肅(su)省武威地(di)區畜(chu)牧學校。

1975年經(jing)甘肅省(sheng)革(ge)命委員(yuan)會下文(wen)恢復甘肅省(sheng)農業機械(xie)化學校，廠(chang)校分家。

1977年高考恢復(fu)，兩校(xiao)開(kai)始招收統一高考的高中畢業生(sheng)，學制三(san)年。

1978年，武威地(di)區(qu)畜牧(mu)學校(xiao)歸屬省管(guan)，隸屬甘肅(su)省農牧(mu)局，恢復甘肅(su)省畜牧(mu)學校(xiao)校(xiao)名(ming)。

1980年，學校被(bei)確定為全(quan)國重點(dian)中等專業(ye)學校。

1994年，學校(xiao)再次被確定為全國重(zhong)點中(zhong)等(deng)專業學校(xiao)。

2000年，學校(xiao)經教育(yu)部專家組評估(gu)驗收，第三次(ci)被確定為國家級重點中等專業學校(xiao)；同年，經甘肅省教育(yu)廳批準，學校(xiao)招收“3+2”高職生。

2004年(nian)6月，經(jing)省(sheng)政府批準，甘(gan)(gan)肅省(sheng)農業機(ji)械化學(xue)校和(he)甘(gan)(gan)肅省(sheng)畜牧學(xue)校合(he)并成立(li)甘(gan)(gan)肅畜牧工(gong)程職業技術(shu)學(xue)院(yuan)。

2005年(nian)5月18日，舉(ju)行甘肅畜牧工程職業(ye)技術學(xue)院成立(li)掛牌慶典。同(tong)年(nian)，在部分專業(ye)招(zhao)收(shou)中(zhong)專學(xue)生的同(tong)時，各高職專業(ye)開始招(zhao)收(shou)三年(nian)制高中(zhong)畢業(ye)生。

2010年7月，學(xue)院被省(sheng)教育廳、省(sheng)財政(zheng)廳確定為(wei)“甘肅省(sheng)省(sheng)級(ji)示范性(xing)高等職業院校”。

2017年(nian)5月，學(xue)院被省(sheng)(sheng)教(jiao)育(yu)廳確定為“甘肅省(sheng)(sheng)優質高(gao)等職業院校(xiao)建設(she)計劃”項(xiang)目培育(yu)學(xue)校(xiao)。

2020年5月，學校被確定為甘肅省農民教育培訓示范基地。

2021年5月，學校被評為全(quan)國鄉(xiang)村振興人才培養優質校。

2021年2月，學(xue)校被(bei)確定為甘肅省“雙高計(ji)劃”建(jian)設單位。

2022年5月，學校被(bei)確定(ding)為甘肅省綠色學校。